
Exploration scientifique
Lancement du projet DIVE-Sea, des explorations aux génomes marins
Copiloté par le CNRS et le CEA, le programme de recherche ATLASea vise à mieux connaître la biodiversité marine. Grâce à son expertise en matière de collecte, de taxonomie et de conservation, le Muséum coordonne le volet de terrain de ce programme DIVE-Sea. Objectif : coordonner la collecte des organismes marins en vue de leur séquençage génomique. Pendant les 7 prochaines années, 4 500 espèces marines de métropole et des territoires ultramarins seront ainsi échantillonnées afin d’établir un atlas génomique et constituer les collections naturalistes du futur.
Il est plus que jamais urgent d’explorer la diversité du vivant. Nous savons qu’il reste probablement 5 fois plus d’espèces à découvrir que celles déjà décrites et que 50 % à 75 % d’entre elles auront disparu à la fin de notre siècle.
Parmi elles, les espèces marines sont particulièrement méconnues. C’est pourquoi la France lance le vaste programme de collecte et d’échantillonnage ATLASea destiné à réaliser le séquençage de génomes de référence de 4 500 espèces marines de métropole et des territoires ultramarins.
Objectif : séquencer le génome
Séquencer un génome permet d’obtenir l’ensemble des cartes de l’enchaînement de ses composantes (gènes et régions non codantes), ce qui constitue un passeport biométrique poussé à l’extrême pour chacune des espèces. Le séquençage renseigne à la fois sur les caractéristiques et le fonctionnement de l’organisme concerné et son histoire de vie personnelle.
L’enjeu est triple :
- Scientifique : le séquençage va générer des données inédites pour identifier la fonction de gènes mais aussi établir les liens entre les individus et mieux comprendre l’évolution des espèces.
- Environnemental : mieux connaître la biodiversité marine ainsi que sa dynamique aidera à mieux préserver les milieux marins.
- Applicatif : la découverte de nouvelles molécules d’intérêt sera utile à la santé, l’agriculture ou l’alimentation.
Explorateurs experts
Au cœur du programme ATLASea, le Muséum coordonne le projet DIVE-Sea qui vise la collecte, l’identification taxonomique et l’acheminement des échantillons jusqu’au Génoscope d’Évry et au Muséum national d'Histoire naturelle pour leur entrée en collection. Un véritable défi ! En la matière, l’expertise du Muséum est particulièrement précieuse. Ses scientifiques, chercheurs, ingénieurs et techniciens mènent depuis des années des programmes d’exploration scientifique à travers le monde et maîtrisent les outils et les méthodes modernes de prélèvements côtiers et profonds.
Des espèces variées sont également cultivées dans ses stations marines de Dinard et Concarneau.
Pour préparer DIVE-Sea, le Muséum a par ailleurs mis au point et testé de nouvelles procédures pour optimiser la collecte et l’identification des spécimens et garantir le respect de la chaîne de froid.
Depuis 2010, plus de 20 % des nouvelles espèces marines décrites dans le monde l’ont été grâce aux campagnes du Muséum.
Taxonomistes, des experts au rôle central
Les taxonomistes tentent de décrire et classer les organismes vivants pour mieux comprendre leur singularité et leurs relations aux autres et à leur milieu. Ce sont eux qui vont s’assurer de l’intérêt des spécimens prélevés et entrer les premiers éléments d’identification et de contexte de vie dans une base de données exploitable par les chercheurs du monde entier.
Des collections du futur pour les chercheurs de demain
Les échantillonnages vont s’étaler jusqu’en 2029 et les séquençages jusqu’en 2031. Mais l’étude de l’ensemble de ces données va perdurer bien au-delà. Une fois les prélèvements biologiques effectués, les spécimens de références resteront accessibles aux chercheurs, car ils vont intégrer les collections du Muséum. Plus inédit, l’établissement conservera par ailleurs une collection de tissus préservés à - 80 °C et les cellules cryopréservées de certaines espèces spécifiques. De quoi alimenter les futures recherches de pointe.
Les stations marines au cœur du dispositif
DIVE-Sea mènera les scientifiques le long du littoral français pour un tour de France des stations marines. Le coup d’envoi des campagnes de collecte sera donné en juin prochain à la station marine de Dinard du Muséum. Mollusques, crustacés, annélides, cnidaires, ascidies, algues, et éponges seront scrutés par près d’une trentaine de participants.
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