Origine, Structure et Evolution de la Biodiversité
UMR 7205 MNHN/CNRS
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GAUDEUL Myriam
Maître de Conférences du Muséum
Contact : gaudeul@mnhn.fr
16 rue Buffon
CP 39
F-75005 Paris
Sujet de stage de M2 pour 2011-2012
Taxonomie & évolution réticulée chez les pivoines
Si vous êtes intéressé(e), contactez-moi !
PROJETS DE RECHERCHE EN COURS
Mes recherches visent à mieux comprendre la diversité biologique observée dans la nature en m’intéressant notamment à son origine (càd aux causes de sa mise en place) et à son évolution.
Mon objectif principal est de combiner des approches micro- et macro-évolutives dans l’étude de la spéciation et de l’endémisme. Pour cela, je me situe à l’interface entre les niveaux ‘population’ et ‘espèce’ puisque la variabilité intra-spécifique constitue le matériau de base à la diversification des espèces. Par ailleurs, j’essaie d’exploiter la complémentarité génotype/phénotype (morphologie, phénologie etc.) et d’adopter des approches descriptives ainsi que mécanistiques (ex. pour élucider les pressions de sélection ayant causé la divergence).
J’ai choisi d’étudier le genre Odontites s. l. (Orobanchaceae, ex-Scrophulariaceae), dont l’aire de répartition est centrée sur le Bassin Méditerranéen. Le genre comporterait 31 espèces (44 taxons), mais les contours des taxons sont souvent flous. Dans un premier temps, le projet consiste à affiner la systématique de ce groupe et à replacer son évolution dans un contexte historique en mettant en place sa phylogénie. Cette première étape permettra de reconstruire l’histoire spatio-temporelle du genre et, par la suite, de cibler certains clades pour élaborer des études plus approfondies sur les évènements de spéciation (incluant les probables cas d’hybridation et d’évolution réticulée), l’adaptation locale et les causes de l’endémisme de certains taxons.
Collaborations : G. Rouhan (MNHN, Pais), E. Vela (IMEP, Marseille) & E. Rico (Univ. Salamanca, Espagne).
Un autre projet s’intéresse à la systématique et la dynamique évolutive du genre Araucaria (Araucariaceae) en Nouvelle-Calédonie. Le genre est composé de 19 espèces dont 13 sont endémiques à la la Nouvelle-Calédonie. Nos objectifs sont (i) d’élucider la biogéographie, l’origine, et la date de diversification du genre Araucaria en Nouvelle-Calédonie (vicariance et/ou dispersion à longue distance ?) et (ii) de déterminer les processus évolutifs responsables de la diversité spécifique élevée dans une région aussi restreinte que la Nouvelle-Calédonie (accumulation d’espèces et/ou radiation adaptative ?). Ces études permettent également de reconsidérer le statut taxonomique de certains groupes et de cartographier les populations naturelles dans une perspective de conservation.
Collaborations : P. Hollingsworth & M. Gardner (Royal Botanic Garden, Edinburgh, UK).
Enfin, un troisième projet s’intéresse aux invasions biologiques. De par les changements environnementaux rapides subis par les espèces envahissantes, elles constituent un véritable « laboratoire naturel » d’évolution biologique et permettent d’étudier les mécanismes en jeu lors de l’expansion d’une espèce.
Nous nous intéressons à Ambrosia artemisiifolia (Asteraceae), originaire d’Amérique du Nord et qui a été introduite en Amérique du Sud, Asie et Europe. L’ambroisie pose de graves problèmes de santé publique (pollen fortement allergène) et est également une mauvaise herbe des cultures. Dans un premier temps, notre objectif est de retracer les voies de colonisation de l’espèce à l’échelle mondiale. Dans un deuxième temps, nous aimerions étudier les rôles relatifs de l’adaptation et de la plasticité phénotypique dans l’expansion de l’espèce.
Collaborations : T. Giraud, J. Shykoff (Laboratoire Ecologie, Systématique et Evolution, Orsay) & L. Kiss (Plant Protection Institute of the Hungarian Academy of Sciences, Budapest, Hongrie).
PARCOURS DE RECHERCHE
Depuis Sept. 2005 : Maître de Conférences du Muséum - UMR CNRS/MNHN 7205, Equipe Botanique.
Post-Doctorat (2004-2005) - Laboratoire d’Ecologie Alpine (LECA), UMR 5553, Grenoble, France
« IntraBioDiv : Tracking surrogates for intraspecific biodiversity - Towards efficient selection strategies for the conservation of natural genetic resources using comparative mapping and modelling approaches »
Post-Doctorat (2003-2004) - Dept of Plant Ecology, Evolutionary Biology Centre, Uppsala, Suède
« Base moléculaire et rôle adaptatif de la production de trichomes foliaires chez Arabidopsis lyrata (Brassicaceae) »
Thèse de Doctorat (1999-2002) - Laboratoire d’Ecologie Alpine (LECA), UMR 5553, Grenoble, France
« Complémentarité des approches génétiques, démographiques et écologiques dans l’étude d’une espèce menacée. Le cas d’Eryngium alpinum L. (Apiaceae), Chardon Bleu des Alpes »
PUBLICATIONS
Andrello M., Bizoux J.-P., Barbet-Massin M., Gaudeul M., Nicolé F. & Till-Bottraud I. 2012. Effects of management regimes and extreme climatic events on plant population viability in Eryngium alpinum. Biological Conservation 147 : 99-106.
Gaudeul M., Rouhan G., Gardner M. F. & Hollingsworth P. M. 2012. AFLP markersprovide insights into the evolutionary relationships and diversification of New Caledonian Araucaria species . American Journal of Botany 99 : 68-81.
This paper made the cover of American Journal of Botany :
Gaudeul M., Giraud T., Kiss L. & Shykoff J. A. 2011. Nuclear and Chloroplast Microsatellites Show Multiple Introductions in the Worldwide Invasion History of Common Ragweed, Ambrosia artemisiifolia. PLoS One 6 : e17658.
Thiel-Egenter C., Alvarez N., Holderegger R., Tribsch A., Englisch T., Wohlgemuth T., Colli L., Gaudeul M., Gielly L., Jogan N., Linder H. P., Negrini R., Niklfeld H., Pellecchia M., Rioux D., Schönswetter P., Taberlet P., van Loo M., Winkler M., Gugerli F. & IntraBioDiv Consortium. 2011. Break zones in the distributions of alleles and species in alpine plants. Journal of Biogeography 38 : 772-782.
Thompson J., Gaudeul M. & Debussche M. 2010. Conservation Value of Sites of Hybridization in Peripheral populations of Rare Plant Species. Conservation Biology 24 : 236-245.
Hollingsworth M., Clark A., Forrest L., Richardson J., Pennington T., Long D., Cowan R., Chase M., Gaudeul M. & Hollingsworth P. 2009. Selecting barcoding loci for plants : evaluation of seven candidate loci with species level sampling in three divergent groups of land plants. Molecular Ecology Ressources 9 : 439-457.
Thiel-Egenter C., Gugerli F., Alvarez N., Brodbeck S., Cieslak E., Colli L., Englisch T., Gaudeul M., Gielly L., Korbecka G., Negrini R., Paun O., Pellechia M., Rioux D., Ronikier M., Schönswetter P., Schüpfer F., Taberlet P., Tribsch A., van Loo M., Winkler M., Holderegger R. & Intrabiodiv Consortium. 2009. Effects of species traits on the genetic diversity of high-mountain plants : a multi-species study across the Alps and the Carpathians. Global Ecology and Biogeography 18 : 78-87.
Alvarez N., Thiel-Egenter C., Tribsch A., Holderegger R., Manel S., Schönswetter P., Taberlet P., Brodbeck S., Gaudeul M., Gielly L., Küpfer K., Mansion G., Negrini R., Paun O., Pellecchia M., Rioux D., Schüpfer F., Van Loo M., Winkler M., Gugerli G. & IntraBioDiv Consortium. 2009. History or ecology ? Substrate type as a major driver of spatial genetic structure in Alpine plants. Ecology Letters 12 : 632-640.
Puscas M., Choler P., Tribsch A., Gielly L., Rioux D., Gaudeul M. & Taberlet P. 2008. Post-glacial history of the dominant alpine sedge Carex curvula in the European Alpine System inferred from nuclear and chloroplast markers. Molecular Ecology 17 : 2417-2429.
Gaudeul M. & Till-Bottraud I. 2008. Genetic structure of the endangered perennial plant Eryngium alpinum (Apiaceae) in an Alpine valley. Biological Journal of the Linnean Society 93 : 667-677.
Mráz P., Gaudeul M., Gielly L., Choler P., Taberlet P. & Intradiodiv Consortium. 2007. Contrasting phylogeographic pattern of the subalpine species Hypochaeris uniflora (Asteraceae) : rapid postglacial colonization of the Alps from an Eastern Alps refugium and vicariance of the Carpathians populations. Journal of Biogeography 34 : 2100-2114.
Gaudeul M., Stenøien H. K. & Ågren J. 2007. Landscape structure, clonal propagation and genetic diversity in Scandinavian populations of Arabidopsis lyrata (Brassicaceae). American Journal of Botany 94 : 1146-1155.
Naciri Y. & Gaudeul M. 2007. Phylogeography of the endangered Eryngium alpinum L. (Apiaceae) in the European Alps. Molecular Ecology 16 : 2721-2733.
Ehrich D., Gaudeul M., Assefa A., Koch M., Mummenhof K., Nemomissa S., Intrabiodiv Consortium & Brochmann C. 2007. Genetic consequences of Pleistocene range shifts : Contrast between the Arctic, the Alps and the East African mountains. Molecular Ecology 16 : 2542-2559.
Manel S., Berthoud F., Bellemain E., Gaudeul M., Luikart G., Swenson J. E., Waits L. P., Taberlet P. & Intrabiodiv Consortium. 2007. A new individual-based spatial approach for identifying genetic discontinuities in natural populations. Molecular Ecology 16 : 2031-2043.
Kivimäki M., Kärkkäinen K., Gaudeul M., Løe G. & Ågren J. 2007. Genetic basis of adaptation : GLABROUS1 and resistance against herbivory in Arabidopsis lyrata. Molecular Ecology 16 : 453-462.
Løe G., Toräng P., Gaudeul M. & Ågren J. 2007. Trichome production and spatiotemporal variation in herbivory in the perennial herb Arabidopsis lyrata (Brassicaceae). OIKOS 116 : 134-142.
Gaudeul M. 2006. Disjunct distribution of Hypericum nummularium (Hypericaceae) : molecular data suggest bidirectional colonization from a single refugium rather than survival in distinct refugia. Biological Journal of the Linnean Society 87 : 437-447.
Thompson J., Lavergne S., Affre L., Gaudeul M. & Debussche M. 2005. Ecological differentiation of Mediterranean endemic plants. Taxon 54 : 967-976.
Gaudeul M. & Till-Bottraud I. 2004. Reproductive ecology of an endangered Alpine plant, Eryngium alpinum L. (Apiaceae) : Phenology, gene dispersal and reproductive success. Annals of Botany 93 : 711-721.
Gaudeul M., Barjon F., Till-Bottraud I. & Manel S. 2004. Genetic diversity and differentiation in Eryngium alpinum L. (Apiaceae) : Comparison of AFLP and microsatellite markers. Heredity 92 : 508-518.
Gaudeul M. & Till-Bottraud I. 2003 Low selfing rate in an endangered perennial plant, Eryngium alpinum L. (Apiaceae). American Journal of Botany 90 : 716-723.
Despres L., Loriot S. & Gaudeul M. 2002. Geographic pattern of genetic variation in the European globeflower Trollius europaeus L. (Ranunculaceae) inferred from AFLP markers. Molecular Ecology 11 : 2337-2347.
Gaudeul M., Naciri-Graven Y., Gauthier P. & Pompanon F. 2002. Isolation and characterisation of microsatellites in a perennial Apiaceae, Eryngium alpinum L. Molecular Ecology Notes 2 : 107-109.
Gaudeul M., Taberlet P. & Till-Bottraud I. 2000. Genetic diversity in an endangered alpine plant, Eryngium alpinum L. (Apiaceae), inferred from AFLP markers. Molecular Ecology 9 : 1625-1637.
