Faune et Flore tropicales publie des ouvrages consacrés à l'identification des animaux, plantes et champignons des régions tropicales. Editée jusqu'alors par l'Institut de Recherche pour le Développement (IRD), la collection est désormais publiée conjointement par cet organisme et le Muséum. Les ouvrages, en français ou en anglais, paraissent sans périodicité fixe. La politique éditoriale de la collection privilégie les ouvrages concernant les pays où est implanté l'IRD et/ou valorisant le patrimoine des collections du Muséum national d'Histoire naturelle. Faune et Flore tropicales fait suite à la Faune de l'Empire Français, devenue Faune de l'Union Française, anciennement publiée par l'Office de la Recherche Scientifique et Technique d'Outre-Mer (ORSTOM).
