ENSEIGNEMENT

Ma plus grosse charge d’enseignement est destinée aux enseignants du secondaire (voir rubrique « diffusion des connaissances »).

Enseignement classique

1995-2003 : Responsable des travaux pratiques de phylogénie moléculaire au DEA "Biodiversité: Génétique, Histoire, Mécanismes de l'Evolution" (Universités de PARIS VI, PARIS VII, PARIS XI, INAPG et Muséum), avec la collaboration d’Annie Tillier (MNHN), d’Eric Pasquet (MNHN) et de Marc Girondot (PARIS VII) : 80 heures/an. Par ailleurs chargé de cours et membre du jury de ce DEA.

Depuis 2004 : membre du jury M2 « Systématique-Evolution-Paléontologie ».

Enseignement en Master M1 et M2 « Systématique-Evolution-Paléontologie » (« SEP ») UPMC-MNHN (cours sur la classification, SEP14 : anatomie comparée, SEP22 : phylogénie moléculaire)

De 1996 à 1999 inclus : Responsable du module de l’école doctorale du Muséum : “Concepts et progrès de la phylogénie des Vertébrés”, avec Hervé Lelièvre (Paléontologie, MNHN) : 4 jours de séminaires par an

Enseignement en seconde année de Médecine à la faculté Xavier Bichat (Classification et phylogénie)

Enseignement à l’ENSAT de Lannion (contour des sciences).

Remarque : il existe aussi des cours donnés ponctuellement, difficiles à répertorier dans la mesure où ils sont irréguliers. Par exemple, en 2005, deux journées (avril et mai) ont été fournies pour le DESS « Egoist » (informatique et génomes) sur le campus de Mont Saint Aignan (à côté de Rouen) ; en 2001 et 2002 trois formations d’une semaine chacune ont été dispensées pour l’INSERM ; en 1996 et 1997 j’ai été responsable d’un module dans le cadre du service de la formation continue du Muséum : “Reconstruction phylogénétique”, etc…).

Formation des étudiants à la recherche par la recherche

Directions de D.E.A et de M2

Remarque : en tant que membre permanent du service de Systématique moléculaire du Muséum, j’ai eu une activité d’encadrement permanente qui nécessite la distinction entre des encadrements partiels ou totaux.

Prise en charge totale

Jérôme DEPAQUIT, 1995. DEA “ interactions Hotes-Parasites ”, Univ. PARIS XII : “ Systématique moléculaire des Phlébotomes (Diptera, Psychodidae). Etude pilote ”. Aujourd’hui en poste en France.

Sébastien LAVOUE, 1995. DEA “ Biodiversité, Génétique et Evolution ”, Univ. PARIS VII : “ Etude pilote pour le choix d’un gène destiné à l’investigation de la position phylogénétique des Cichlidae au sein des Percomorphes ”. Aujourd’hui en post-doc au Japon.

Nicolas VIDAL, 1996. DEA “ Interactions toxiques dans les ecosystèmes et biotechnologies liées aux toxines ”. MNHN : “ Phylogénie moléculaire des Crotalinae ”. Aujourd’hui en poste en France.

Wei-Jen CHEN, 1997. DEA “ Biodiversité : génétique, histoire et mécanismes de l’évolution ”. PARIS VI : “ Phylogénie moléculaire des Channichthyidae, famille de téléostéens antarctiques ”. Aujourd’hui en post-doc aux U.S.A.

Nicolas DEROME, 1999. DEA “ Biodiversité : génétique, histoire et mécanismes de l’évolution ”, PARIS XI : « Phylogénie des Perciformes antarctiques: les Notothenioidei terminaux (Artedidraconidae, Harpagiferidae, Bathydraconidae) ». Aujourd'hui en poste au Canada.

Sophie SANCHEZ, 2003. DEA “ Biodiversité : génétique, histoire et mécanismes de l’évolution ”, PARIS VI: « Phylogénie des Nototheniidae». Aujourd’hui en thèse.

Damien HINSINGER, 2006. M2 "Phylogénie des Serranidae". Aujourd’hui en thèse.

Marie FISLER, 2010. M2 « Logique, Philosophie, Histoire et Sociologie des Sciences » (Paris VII)"La métaphore de l'arbre dans l'histoire des Sciences Naturelles".

Prise en charge partielle

Cécile ROLLAND, 1995. DEA : “ Ecologie générale et production végétale ”, PARIS VI : “ L’évolution de la colonialité chez les oiseaux : approche comparative ”.

Olivier CLEMENT, 1997 : DEA “ Systématique animale et végétale ”. MNHN : “ Phylogénie et polymorphisme enzymatique de la famille des Channichthyidae, poissons antarctiques ”.

Karine LHEULLIER, 1997 : DEA “ Biodiversité : génétique, histoire et mécanismes de l’évolution ”. PARIS VI.

Grégory JANER, 1997 : DEA “ Biodiversité : génétique, histoire et mécanismes de l’évolution ”. PARIS VI : “ Approche de la phylogénie moléculaire des Scleractinia ”.

Christophe DOUADY, 1997 : DEA “ Systématique animale et végétale ”. MNHN : “ Pour une phylogénie et une approche évolutive du genre Cisticola (Aves, Passeriformes, Cisticolidae) : méthodologie et analyse de caractères morphologiques et éco-éthologiques ”. Aujourd’hui en poste.

Mohamed BERKANI, 2008 : M2 “ Systématique, Evolution, Paléontologie ”. MNHN : “ Phylogénie des notothéniidés, téléostéens antarctiques ”.

Anne-Claire LAUTREDOU, 2009 : M2 “ Systématique, Evolution, Paléontologie ”. MNHN : “ Relations de parenté et phylogéographie au sein des Liparidae (Gill, 1861) ”. Aujourd’hui en thèse.

Directions de thèses

Note : Mes doctorants ont tous une allocation

Wei-Jen CHEN, 1997-2000 : Phylogénie des Percomorphes, Thèse PARIS VI soutenue en janvier 2001 (ED « Diversité du Vivant »). Aujourd'hui en poste à Taïwan.

Agnès DETTAï, 2000-2003 : phylogénie des Acanthomorpha, Thèse Paris VI (ED « Diversité du Vivant ») soutenue en mars 2004. Aujourd’hui en poste en France.

Blaise LI, 2004-2007 : La fiabilité des phylogénies, application aux acanthomorphes. Thèse Paris VI (ED « Diversité du Vivant ») soutenue en septembre 2008. Aujourd'hui en post-Doc.

Directions partielles de thèses

Nicolas VIDAL, 1996-1999 : Phylogénie, écologie et toxicologie des serpents venimeux, thèse Muséum soutenue en juin 2000 (ED MNHN). Aujourd’hui en poste en France.

Julie MARIN, 2009-2012 : Phylogénie et biogéographie des serpents fouisseurs (Scolecophidia) : 1700 nouvelles espèces de vertébrés terrestres à décrire ?, co-encadrement Nicolas Vidal.

Anne-Claire LAUTREDOU, 2009-2012 : Phylogénie des serraniformes : implications pour la systématique des téléostéens acanthomorphes, co-encadrement Agnès Dettaï.

Direction de stages post-doctoraux

Francesco SANTINI, stage post-doctoral de deux ans (mai 2003 - mai 2005) sur la phylogénie des téléostéens acanthomorphes par l’approche anatomique et moléculaire, financé par une bourse européenne Marie Curie. Précédemment, sa thèse avait eu lieu à l’université de Toronto, Canada.

Chomin CUNCHILLOS, stage post-doctoral (septembre 2004 - septembre 2006) financé par la compagnie Saint-Gobain sur l ‘épistémologie des notions de vivant et d’unité de niveaux d’intégration ; ainsi que sur la biochimie comparative.

Direction d’autres stages

- Philippe LOPEZ d'Octobre 1994 à Janvier 1995. Sujet: "Position phylogénétique de la Tanche au sein des Cyprinidés : investigation moléculaire". Aujourd’hui en poste en France.

- Peter RITCHIE, doctorant neozélandais, de Juillet 1995 à Mars 1996. Sujet : "phylogénie moléculaire des poissons antarctiques". Aujourd’hui en poste en Nouvelle-Zélande.

- Christelle THAERON en Juillet-Août 1995 pour un stage de Maîtrise, poursuivant le thème de Philippe Lopez sur la Tanche.

- Lucie BITTNER en 2005 pour un stage de Maîtrise, sur la phylogénie moléculaire des liparidés (téléostéens).

- Astrid CRUAUD en 2006 pour un stage de Maîtrise, sur la phylogénie des téléostéens acanthomorphes.

Dernière actualisation : jullet 2010

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